Het circuit van een elektronische muggenmepper bestaat hoofdzakelijk uit een hoog{0}}oscillatiecircuit, een step--transformator en een gelijkrichtcircuit met spanningsvermenigvuldiger. Nadat u op de aan/uit-schakelaar hebt gedrukt, zet het oscillatiecircuit de lage gelijkspanning van de batterij om in hoogfrequente wisselstroom. Dit wordt aanvankelijk door de transformator opgevoerd tot enkele honderden volts, en vervolgens verder opgevoerd tot een hoog-gelijkspanningsspanning van 1500 V-4200 V door het spanningsvermenigvuldigingsgelijkrichtercircuit bestaande uit diodes en condensatoren, en vervolgens toegepast op het metalen gaasrooster.
De meeste producten gebruiken een drie-laagse metalen gaasstructuur. De buitenste twee lagen metaalgaas hebben dezelfde polariteit en de middelste laag heeft de tegenovergestelde polariteit. Wanneer insecten zoals muggen en vliegen tegelijkertijd in contact komen met de buitenste en middelste lagen van het gaas, fungeren hun lichamen als geleiders, vormen een kortsluiting, veroorzaken een hoge- ontlading en worden gedood door de stroom en de elektrische boog.
De veiligheid van elektrische muggenmeppers is gebaseerd op een "hoogspanning, lage stroom"-ontwerp. Hun bedrijfsspanning kan enkele duizenden volts bereiken, maar de uitgangsstroom is extreem klein, doorgaans tussen enkele milliampère en tientallen milliampère. Industrienorm QB/T 4496-2013 bepaalt dat de werkspanning van het hoogspanningsgaas van een elektrische muggenmepper binnen het bereik van 2000V~4200V moet liggen.
Onder normale omstandigheden wordt het buitenste gaas niet opgeladen en heeft het product de mogelijkheid om resterende elektriciteit te elimineren, waardoor de inter-maasspanning binnen enkele seconden nadat de stroom is uitgeschakeld tot een veilig bereik wordt teruggebracht. Alle monsters waren in staat om de spanning binnen 5 seconden na het uitschakelen van de stroom terug te brengen tot onder de veilige menselijke spanning van 36 V.
Sommige geavanceerde- of nieuwere modellen integreren een muggen--aantrekkende functie. Dit werkt door gebruik te maken van de fototaxis van muggen, waarbij ultraviolet licht met een specifieke golflengte wordt uitgezonden om muggen naar het elektrische gaas te lokken.